zhouying_ch@qq.com ZhouYing0818 个人博客 谷歌学术 ResearchGate

个人简介

致力于将计算生物学应用于生物医学研究领域。在复旦大学期间,通过整合计算与实验方法研究中间神经元分类与脑回发育,深化了对神经发育及电生理数据分析的理解。随后的临床研究经历激发了我对优化基因变异解读计算方法的兴趣,而在哈尔滨医科大学的深造则进一步提升了我利用生物信息学方法探索脑肿瘤与神经干细胞关联的能力。熟练掌握多组学数据分析(包括sc/snRNA-seq、ChIP-seq、WES/WGS等),能运用统计学习与生物信息学流程处理从电生理信号到测序的多种生物数据。

教育经历

硕士 | 哈尔滨医科大学,生物医学工程(生物信息学方向)

2022.09 - 2025.06

GPA 3.8,研究方向:scRNA-seq、ChIP-seq、CUT&RUN|TAG、Ribo-seq、AS|APA、CRISPR Screens等

硕士 | 复旦大学,神经生物学(神经发育与神经元分类)

2016.09 - 2020.01

论文答辩 92.32/100分,GPA 2.99/4.0

学士 | 湖南农业大学,生物工程

2012.09 - 2016.06

GPA 3.59/4.0

项目经历

胶质母细胞瘤(GBM)与神经发育轨迹的系统比较

2023.01 - 2025.06

整合分析了5个GBM单细胞/单核转录组数据集,将数据与胎儿发育轨迹进行比对,系统描绘了GBM中动态变化的分子表达谱

哈尔滨医科大学

基于bulk与单细胞RNA测序及机器学习发现骨关节炎诊断性生物标志物

2025.07 - 2026.11

整合bulk与单细胞RNA-seq数据,利用机器学习方法鉴定骨关节炎诊断的5基因生物标志物组合

自由职业生物信息工程师

探索非酒精性脂肪肝中配体-受体相关基因的潜在关系

2025.07 - 2026.11

结合bulk与单细胞RNA-seq数据,利用机器学习与计算药物发现方法,鉴定NAFLD中配体-受体互作相关生物标志物

自由职业生物信息工程师

通过熵加权集成多种工具改进外显子组分析中的变异优先级排序(共同第一作者,已发表)

2020.05 - 2022.10

在大型罕见病队列中对多种变异优先级排序工具进行基准测试,采用熵加权集成方法优化变异优先级排序

上海交通大学医学院附属新华医院

Sncg、Mybpc1和Parm1对体感皮层VIP阳性中间神经元亚群的分类(已发表)

2017 - 2020.05

应用无监督学习和机器学习方法分析高维形态学与电生理数据,构建定量特征提取方法分类VIP+中间神经元亚群

复旦大学

断奶后隔离对C57BL/6J小鼠焦虑和抑郁样行为的影响(已发表)

2016 - 2017

参与构建断奶后社会隔离小鼠模型,系统评估隔离应激对小鼠焦虑样和抑郁样行为的影响,包括旷场实验、高架十字迷宫、强迫游泳和悬尾实验等一系列行为学范式

复旦大学

专业技能

编程与数据分析

Python R MATLAB 数据挖掘 机器学习 AWS Nextflow PyTorch Vibe Coding

生物信息学与组学分析

Bulk/ScRNA-seq ChIP-seq CUT&RUN/CUT&TAG Ribo-seq 及其他分子生物信息分析

神经生物学数据分析

神经元形态学分析 电生理信号分析 显微镜图像分析

发表论文

Fan Y, Zhou Y*, Liu H, Luo X, Xu T et al. Improving variant prioritization in exome analysis by entropy-weighted ensemble of multiple tools. Clin Genet. Oct 2022.

doi:10.1111/cge.14257

Jiang SN, Cao JW, Liu LY, Zhou Y, Liu H, Shan GY, Fu YH, Shao YC, Yu YC. Sncg, Mybpc1, and parm1 classify subpopulations of VIP-expressing interneurons in layers 2/3 of the somatosensory cortex. Cereb Cortex. Aug 2022.

doi:10.1093/cercor/bhac343

Huang Q, Zhou Y, Liu LY. Effect of post-weaning isolation on anxiety- and depressive-like behaviors of C57BL/6J mice. Experimental Brain Research. 2017.

doi:10.1007/s00221-017-5021-5

学术会议

  • The second international conference on single-cell and spatial omics (TICSSO-2)

    Mar 2024 · Shenzhen

  • 2020 conference of Medical Geneticists Branch of Chinese Medical Doctor Association

    Oct 2020 · Chengdu

  • The 11th FENS Forum of Neuroscience

    Jul 2018 · Berlin

  • The 12th National Academic Conference of Chinese Society for Neuroscience

    2017 · Tianjin

荣誉与证书

  • 临床医学检验师(初级)考试通过(2026.06,成绩已出,待发证)

  • 上海计算机等级考试三级(数据科学与人工智能)

  • 全国计算机等级考试二级VB语言

  • 湖南省计算机应用等级考试二级

  • 哈尔滨医科大学研究生科研与实践创新计划

  • 复旦大学神经科学奖学金

  • 复旦大学光华奖学金

  • 湖南农业大学三好学生

  • 中国细胞生物学学会科普工作者证书

工作经历

生信工程师

爱彼爱科(丽水)医学检验实验室有限公司 / 浙江大学丽水生命健康研究中心甲基化实验室

2025.12 - 至今

负责甲基化精神压力检验模型构建(2025.12.1-至今),同丽水市第二人民医院展开青少年抑郁甲基化诊断研究项目合作。跨国同加拿大 Moshe Szyf 教授(麦吉尔大学/香港大学)团队合作,将学术研究向医学和健康管理进行转化。

临床数据分析师

聚道科技(GeneDock),派驻上海交通大学医学院附属新华医院上海市儿科研究所

2020.05 - 2022.06

参与了2项WES/WGS项目,作为共同第一作者发表了遗传变异自动解读项目论文